(1) выбар абсталявання. Пры выбары фармацэўтычнага абсталявання існуюць некаторыя праблемы, такія як выбар на аснове вопыту (без фактычных разлікаў або недастатковых разлікаў дадзеных), сляпое імкненне да прагрэсу і недастатковае вывучэнне фізічных дадзеных, якія сур'ёзна ўплываюць на практычнасць і эканамічнасць абсталявання.

(2) мантаж абсталявання і навучанне. У працэсе мантажу фармацэўтычнага абсталявання часта надаюць увагу ходу будаўніцтва, ігнаруючы якасць будаўніцтва, што прыводзіць да павелічэння выдаткаў на абслугоўванне абсталявання ў далейшым перыядзе. Акрамя таго, недастатковая падрыхтоўка персаналу па абслугоўванні і эксплуатацыі абсталявання таксама стварае рызыкі для кіравання і абслугоўвання фармацэўтычнага абсталявання.

(3) недастатковыя інвестыцыі ў кіраванне і абслугоўванне інфарматызацыі. У наш час, хоць многія прадпрыемствы надаюць вялікае значэнне кіраванню абсталяваннем і яго тэхнічнаму абслугоўванню, а таксама кіраванню запісамі аб тэхнічным абслугоўванні абсталявання і ўліку асноўных параметраў, некаторыя праблемы ўсё яшчэ існуюць, такія як цяжкасці з пастаянным забеспячэннем дадзеных аб тэхнічным абслугоўванні, адсутнасць эфектыўнай інфармацыі аб спецыфікацыях фармацэўтычнага абсталявання, такой як спецыфікацыі, чарцяжы і г.д., што нябачна павялічвае складанасць кіравання абсталяваннем, яго тэхнічнага абслугоўвання і рэканструкцыі.

(4) сістэма кіравання. Адсутнасць эфектыўнай сістэмы і метадаў кіравання прыводзіць да недастатковага кіравання персаналам па тэхнічным абслугоўванні фармацэўтычнага абсталявання, адсутнасці стандартызацыі працы персаналу па тэхнічным абслугоўванні, што стварае схаваныя пагрозы для бяспекі ў працэсе кіравання фармацэўтычным абсталяваннем і тэхнічным абслугоўваннем.